Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms