Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms