Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4EQ9ULY5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms