Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms