Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms