Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms