Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms