Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCC2Q9HCC0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms