Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms