Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms