Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRACR2AQ9BSW2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms