Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPAS2Q99743 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms