Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms