Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT140Q96RY7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT140Q96RY7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT140Q96RY7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT140Q96RY7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT140Q96RY7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT140Q96RY7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT140Q96RY7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT140Q96RY7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT140Q96RY7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT140Q96RY7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT140Q96RY7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms