Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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