Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms