Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF128Q8TEB7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF128Q8TEB7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF128Q8TEB7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF128Q8TEB7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF128Q8TEB7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF128Q8TEB7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF128Q8TEB7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF128Q8TEB7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF128Q8TEB7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF128Q8TEB7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF128Q8TEB7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF128Q8TEB7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms