Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms