Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF548Q8NEK5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF548Q8NEK5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF548Q8NEK5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF548Q8NEK5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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