Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CLIP4Q8N3C7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CLIP4Q8N3C7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CLIP4Q8N3C7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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