Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms