Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf89Q6UX73 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms