Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225Q6GV28 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms