Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms