Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms