Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LACTB2Q53H82 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms