Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms