Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP13-4Q3LI77 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms