Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms