Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms