Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMU1Q2TAY7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms