Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC57Q2TAC2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC57Q2TAC2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms