Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms