Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK13Q14004 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms