Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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