Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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