Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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