Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms