Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms