Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms