Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK17Q00537 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK17Q00537 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms