Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EFNB1P98172 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms