Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP25P60880 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms