Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA8P53708 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA8P53708 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms