Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRXP46100 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRXP46100 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms