Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms