Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms