Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYKP34925 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYKP34925 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RYKP34925 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms