Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms