Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENRO43583 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms